Ein besonders großes Anliegen war Prof. Stefan Kocsis eine neue Orgel für die Pfarrkirche in Oberpullendorf, wodurch u. a. auch das Veranstalten von Orgelkonzerten ermöglicht werden sollte. Das Instrument wurde von der Orgelbaufirma Gregor Hradetzky erbaut und im Jahr 1967 im Rahmen eines Festkonzertes eingeweiht. Die zahlreichen Orgelkonzerte, die vielen ORF-Aufnahmen sowie die etwa zehn Live-Messen im Rundfunk aus der Oberpullendorfer Pfarrkirche unterstreichen die Richtigkeit der Entscheidung, dieses neue Instrument trotz des anfänglichen Widerstands anzuschaffen.

Die Orgel mit rein mechanischer Traktur (wobei alle Bauteile aus Holz bestehen) hat 19 Register mit über 1700 Pfeifen, 2 Manuale und ein Pedal. Sie ist auf 8’-Basis intoniert. Prof. Kocsis war von Beginn an äußerst bedacht auf eine perfekte Intonation und einen exakten Winddruck, wodurch eine sehr individuelle Tongebung möglich ist. Dieses Instrument war die erste mechanische Kirchenorgel der Firma Hradetzky im Burgenland. Eine genaue Beschreibung der Bau- und Funktionsweise kann unter dem Kapitel „Orgelvorführung“ nachgelesen werden, das das Ergebnis eines zweistündigen Unterrichtsbesuchs des Projektteams in der Oberpullendorfer Kirche ist. Dabei stellte Prof. Stefan Kocsis das Instrument Orgel in äußerst anschaulicher Art und Weise und vor allem anhand vieler praktischer Beispiele und Hörproben vor. Dass er den SchülerInnen im Rahmen dieses Lehrausgangs auch einige virtuose Orgelwerke vorführte, versteht sich von selbst, denn gerade dadurch konnten die klanglichen Eigenschaften und hervorragenden Möglichkeiten eines solchen Meisterinstruments eindrucksvoll verdeutlicht werden.